計算允許退還的留抵稅額涉及的進項構成比例，為2019年4月至申請退稅前一稅款所屬期已抵扣的增值稅專用發票（含帶有“增值稅專用發票”字樣全面數字化的電子發票、稅控機動車銷售統一發票）、收費公路通行費增值稅電子普通發票、海關進口增值稅專用繳款書、解繳稅款完稅憑證注明的增值稅額占同期全部已抵扣進項稅額的比重。
為減輕納稅人退稅核算負擔，在計算進項構成比例時，納稅人在上述計算期間內發生的進項稅額轉出部分無需扣減。
舉例說明：某制造業納稅人2019年4月至2022年3月取得的進項稅額中，增值稅專用發票500萬元，道路通行費電子普通發票100萬元，海關進口增值稅專用繳款書200萬元，農產品收購發票抵扣進項稅額200萬元。2021年12月，該納稅人因發生非正常損失，此前已抵扣的增值稅專用發票中，有50萬元進項稅額按規定作進項稅轉出。該納稅人2022年4月按照14號公告的規定申請留抵退稅時，進項構成比例的計算公式為：進項構成比例=（500＋100＋200）÷（500＋100＋200＋200）×100%=80%。進項轉出的50萬元，在上述計算公式的分子、分母中均無需扣減。
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